Sebagai lembaga yang kekuatannya ditentukan melakukan kerja sama. LAZISMU telah menginisiasi memperkuat eksistensinya dengan membangun kerjasama dengan berbagai pihak,baik pemerintah, swasta, maupun organisasi masyarakat sipil lainnya.
Secara internal, LAZISMU juga membangun kemitraan dengan majelis, lembaga dan ortom (MLO)Muhammadiyah. Kerjasama dibangun dengan pemerintah sebagai bagian dari upaya mensinergikan gerakan filantropi Islam dengan misi yang dimiliki pemerintah.Bersama MLO Muhammadiyah, LAZISMU Sragen telah membangun kemitraan untuk menjalankan berbagai program.